Öz
Giriş: Bu çalışmada metallo-beta-laktamaz üreten Pseudomonas aeruginosa (MBL-PA) suşlarının moleküler epidemiyolojik özelliklerinin belirlenmesi ve MBL-PA varlığının hasta mortalitesi ve morbiditesi ile ilişkisinin değerlendirilmesi amaçlandı.
Gereç ve Yöntem: Karadeniz Teknik Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi"nde 2009-2010 yıllarında bir, çeşitli klinik örneklerden izole edilmiş 334 karbapenem dirençli P. aeruginosa kökeni çalışmaya dahil edildi. Karbapenem dirençli PA izolatlarında MBL varlığı fenotipik olarak Modified Hodge ve imipenem/imipenem-etilen diamin tetra asetik asit kombine disk testleri ile araştırıldı. MBL üretiminden sorumlu genlerden olan blaIMP, blaVIM, blaGIM, blaSIM ve blaSPM genlerinin varlığı çoklu polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile araştırıldı. MBL-PA olduğu belirlenen suşların klonal ilişkisi pulsed-field jel elektroforez ile analiz edildi. Hastaların tıbbi kayıtları geriye dönük olarak MBL-PA ile ilişkisi açısından incelendi. Metallo-beta-laktamaz üreten Pseudomonas aeruginosa ve non-MBL-PA izole edilen hastaların çeşitli demografik ve klinik özellikleri istatistiksel olarak değerlendirildi.
Bulgular: Karbapenemlere dirençli PA suşlarının 32"sinde (%9,6) blaVIM ve/veya blaIMP olumlu saptandı. Bunların üç tanesinin aynı anda blaVIM ve blaIMP geni taşıdığı tespit edildi. MBL-PA suşlarının aminoglikozidlere ve kinolonlara direnç oranlarının daha yüksek olduğu görüldü. Erişkinlerde saptanan VIM tipi MBL üreten PA suşlarından sekizinin identik olduğu görüldü ve gerek erişkin gerekse çocuk hastalardan izole edilen MBL-PA'lar arasında klonal kümelenmeler saptandı. Karbapenem dirençli PA izole edilenler hastalardan, MBL-PA ve non-MBL-PA grupları arasında incelenen risk faktörleri ve mortalite açısından fark bulunmamıştır.
Sonuç: Metallo-beta-laktamaz üreten Pseudomonas aeruginosa izolasyonu ile ilişkili özellikli bir risk faktörü saptanmamış olsa da MBL-PA'nın sağlık bakımı kaynaklı çeşitli salgınlara neden olduğu gösterilmiştir. Ayrıca bildiğimiz kadarıyla çalışmamız, Türkiye"de blaVIM ve blaIMP genlerinin aynı anda saptandığı PA izolatlarını rapor eden ilk çalışmadır.
Anahtar Kelimeler: Pseudomonas aeruginosa, karbapenem direnci, metallo-beta-laktamaz, blaIMP, blaVIM, pulsed-field jel elektroforez
Kaynakça
Hong DJ, Bae IK, Jang IH, Jeong SH, Kang HK, Lee K. Epidemiology and Characteristics of metallo-β-lactamase-producing Pseudomonas aeruginosa. Infect Chemother. 2015;47:81-97.
Cornaglia G, Giamarellou H, Rossolini GM. Metallo-β-lactamases: a last frontier for β-lactams? Lancet Infect Dis. 2011;11:381-93.
Malkoçoğlu G, Aktaş E, Bayraktar B, Otlu B, Bulut ME. VIM-1, VIM-2, and GES-5 Carbapenemases among Pseudomonas aeruginosa isolates at a tertiary hospital in Istanbul, Turkey. Microb Drug Resist. 2017;23:328-34.
Bahar G, Mazzariol A, Koncan R, Mert A, Fontana R, Rossolini GM, Cornaglia G. Detection of VIM-5 metallo-beta-lactamase in a Pseudomonas aeruginosa clinical isolate from Turkey. J Antimicrob Chemother. 2004;54:282-3.
Ozgumus OB, Caylan R, Tosun I, Sandalli C, Aydin K, Koksal I. Molecular epidemiology of clinical Pseudomonas aeruginosa isolates carrying IMP-1 metallo-beta-lactamase gene in a university hospital in Turkey. Microb Drug Resist. 2007;13:191-8.
Yakupogullari Y, Poirel L, Bernabeu S, Kizirgil A, Nordmann P. Multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa isolate co-expressing extended-spectrum beta-lactamase PER-1 and metallo-beta-lactamase VIM-2 from Turkey. J Antimicrob Chemother. 2008;61:221-2.
Iraz M, Duzgun AO, Cicek AC, Bonnin RA, Ceylan A, Saral A, Nordmann P, Sandalli C. Characterization of novel VIM carbapenemase, VIM-38, and first detection of GES-5 carbapenem-hydrolyzing β-lactamases in Pseudomonas aeruginosa in Turkey. Diagn Microbiol Infect Dis. 2014;78:292-4.
Er H, Altındiş M, Aşık G, Demir C. Molecular epidemiology of beta-lactamases in ceftazidime-resistant Pseudomonas aeruginosa isolates. Mikrobiyol Bul. 2015;49:156-65.
Zavascki AP, Barth AL, Gonçalves AL, Moro AL, Fernandes JF, Martins AF, Ramos F, Goldani LZ. The influence of metallo-β-lactamase production on mortality in nosocomial Pseudomonas aeruginosa infections. J Antimicrob Chemother. 2006;58:387-92.
Zaoutis TE, Goyal M, Chu JH, Coffin SE, Bell LM, Nachamkin I, McGowan KL, Bilker WB, Lautenbach E. Risk factors for and outcomes of bloodstream infection caused by extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella species in children. Pediatrics. 2005;115:942-9.
Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing; 20th Informational Supplement (M100-S20);2010. Last Accessed date: 4 March 2019. Available from: https://www.researchgate.net/file.PostFileLoader.html?id=50f0395de 39d5e8368000022&assetKey=AS%3A272 179910905 873%401441 904155 623
Pitout JD, Gregson DB, Poirel L, McClure JA, Le P, Church DL. Detection of Pseudomonas aeruginosa producing metallo-beta-lactamases in a large centralized laboratory. J Clin Microbiol. 2005;43:3129-35.
Sepp R, Szabó I, Uda H, Sakamoto H. Rapid techniques for DNA extraction from routinely processed archival tissue for use in PCR. J Clin Pathol. 1994;47:318-23.
Mendes RE, Kiyota KA, Monteiro J, Castanheira M, Andrade SS, Gales AC, Pignatari AC, Tufik S. Rapid detection and identification of metallo-beta-lactamase encoding genes by multiplex real-time PCR assay and melt curve analysis. J Clin Microbiol. 2007;45:544-7.
Tsakris A, Pournaras S, Woodford N, Palepou MF, Babini GS, Douboyas J, Livermore DM. Outbreak of infections caused by Pseudomonas aeruginosa producing VIM-1 carbapenemase in Greece. J Clin Microbiol. 2000;38:1290-2.
Noyal MJ, Menezes GA, Harish BN, Sujatha S, Parjia SC. Simple screening tests for detection of carbapenemases in clinical isolates of nonfermentative Gram-negative bacteria. Indian J Med Res. 2009;129:707-12.
Pellegrino FL, Teixeira LM, Carvalho Md Mda G, Aranha Nouér S, Pinto De Oliveira M, Mello Sampaio JL, D"Avila Freitas A, Ferreira AL, Amorim Ed Ede L, Riley LW, Moreira BM. Occurrence of a multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa clone in different hospitals in Rio de Janeiro, Brazil. J Clin Microbiol. 2002;40:2420-4.
Ballarini A, Scalet G, Kos M, Cramer N, Wiehlmann L, Jousson O. Molecular typing and epidemiological investigation of clinical populations of Pseudomonas aeruginosa using an oligonucleotide-microarray. BMC Microbiol. 2012;12:152.
Rizek C, Fu L, Dos Santos LC, Leite G, Ramos J, Rossi F, Guimaraes T, Levin AS, Costa SF. Characterization of carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa clinical isolates, carrying multiple genes coding for this antibiotic resistance. Ann Clin Microbiol Antimicrob. 2014;13:43.
Castanheira M, Deshpande LM, Costello A, Davies TA, Jones RN. Epidemiology and carbapenem resistance mechanisms of carbapenem-non-susceptible Pseudomonas aeruginosa collected during 2009-11 in 14 European and Mediterranean countries. J Antimicrob Chemother. 2014;69:1804-14.
Baran I, Aksu N. Phenotypic and genotypic characteristics of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in a tertiary-level reference hospital in Turkey. Ann Clin Microbiol Antimicrob. 2016;15:20.
Kilic A, Aktas Z, Bedir O, Gumral R, Bulut Y, Stratton C, Tang YW, Basustaoglu AC. Identification and characterization of OXA-48 producing, carbapenem-resistant Enterobacteriaceae isolates in Turkey. Ann Clin Lab Sci. 2011;41:161-6.
Sahin K, Tekin A, Ozdas S, Akin D, Yapislar H, Dilek AR, Sonmez E. Evaluation of carbapenem resistance using phenotypic and genotypic techniques in Enterobacteriaceae isolates. Ann Clin Microbiol Antimicrob. 2015;14:44.
Aksoy MD, Çavuşlu Ş, Tuğrul HM. Investigation of metallo beta lactamases and oxacilinases in carbapenem resistant Acinetobacter baumannii strains isolated from inpatients. Balkan Med J. 2015;32:79-83.
Kulah C, Mooij MJ, Comert F, Aktas E, Celebi G, Ozlu N, Rijnsburger MC, Savelkoul PH. Characterisation of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii outbreak strains producing OXA-58 in Turkey. Int J Antimicrob Agents. 2010;36:114-8.
Gupta V. Metallo beta lactamases in Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter species. Expert Opin Investig Drugs. 2008;17:131-43.
Walsh TR, Toleman MA, Poirel L, Nordmann P. Metallo-beta-lactamases: the quiet before the storm? Clin Microbiol Rev. 2005;18:306-25.
Lucena A, Dalla Costa LM, Nogueira KS, Matos AP, Gales AC, Paganini MC, Castro ME, Raboni SM. Nosocomial infections with metallo-beta-lactamase-producing Pseudomonas aeruginosa: molecular epidemiology, risk factors, clinical features and outcomes. J Hosp Infect. 2014;87:234-40.
Nouér SA, Nucci M, de-Oliveira MP, Pellegrino FL, Moreira BM. Risk factors for acquisition of multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa producing SPM metallo-beta-lactamase. Antimicrob Agents Chemother. 2005;49:3663-7.
Hirakata Y, Yamaguchi T, Nakano M, Izumikawa K, Mine M, Aoki S, Kondoh A, Matsuda J, Hirayama M, Yanagihara K, Miyazaki Y, Tomono K, Yamada Y, Kamihira S, Kohno S. Clinical and bacteriological characteristics of IMP-type metallo-beta-lactamase-producing Pseudomonas aeruginosa. Clin Infect Dis. 2003;37:26-32.
Laupland KB, Parkins MD, Church DL, Gregson DB, Louie TJ, Conly JM, Elsayed S, Pitout JD. Population-based epidemiological study of infections caused by carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa in the Calgary Health Region: importance of metallo-beta-lactamase (MBL)-producing strains. J Infect Dis. 2005;192:1606-12.
