Türkiye’deki Üçüncü Basamak Bir Hastanede Klinik Örneklerden İzole Edilen Karbapenem Dirençli Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında blaKPC Geninin PCR ile Araştırılması
PDF

ÖZGÜN MAKALE

Türkiye’deki Üçüncü Basamak Bir Hastanede Klinik Örneklerden İzole Edilen Karbapenem Dirençli Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında blaKPC Geninin PCR ile Araştırılması

Mediterr J Infect Microb Antimicrob 2019;8:3-3 DOI: 10.4274/mjima.galenos.2019.2019.3
, , , , ,
PDF
İzin

Öz

Giriş: Karbapenem direncinin gelişiminde en önemli mekanizmalarından biri karbapenemazlardır. Son zamanlarda yeni ve farklı bir karbapenemaz olan Klebsiella pneumoniae karbapenemaz (KPC) Türkiye’de de görülmeye başlanmıştır. Klebsiella pneumoniae karbapenemazlar blaKPC geni tarafından kodlanır ve farklı türler arasında aktarılabilir. Türkiye‘de blaKPC geni bulunan izolat bildirimleri oldukça azdır. Bu nedenle çalışmamızda Türkiye’deki bir üçüncü basamak hastanede karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae ve Escherichia coli kökenlerinde blaKPC geninin varlığının araştırılması amaçlanmıştır.

Gereç ve Yöntem: Çalışmamızda Kasım 2013-Kasım 2014 tarihleri arasında Adana Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi’nin çeşitli klinik birimlerinden Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na gönderilen hasta örnekleri alındı. Farklı klinik örneklerden izole edilen K. pneumoniae ve E. coli kökenleri konvansiyonel yöntemlere ek olarak VITEK® 2.0 (bioMérieux, Fransa) otomatize sistemi ile tanımlandı ve imipenem-silastatin, meropenem ve ertapenem duyarlılıkları VITEK® 2.0 otomatize antibiyotik duyarlılık sistemi (bioMérieux, Fransa) ile çalışıldı. Ayrıca, blaKPC geni varlığı polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile araştırıldı.

Bulgular: Karbapenem dirençli 49 adet K. pneumoniae ve 33 adet E. coli suşu çalışmaya dahil edildi. Test ettiğimiz karbapenem grubu antibiyotikler içinde en yüksek direnç oranı K. pneumoniae’da %98,0 ve E. coli’de %84,8 ile ertapeneme karşı tespit edildi. Polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile bir K. pneumoniae izolatında blaKPC geni varlığı belirlendi.

Sonuç: Literatür taramalarımızda ulaşabildiğimiz kadarıyla, çalışmamız Türkiye’deki KPC üreten K. pneumoniae izolasyonunu sunan ilk yayınlardan biridir. Bu bulgu, blaKPC ile horizontal olarak yayılabilen karbapenem direncinin araştırılması gerektiğini göstermiştir. Enfeksiyon kontrolü ve antimikrobiyal kullanım politikalarının belirlenmesinde, antimikrobiyal duyarlılık oranlarının sürekli olarak izlenmesi ve bölgesel farklılıkların gözlemlenmesi oldukça önemli yol göstericilerdir.

Anahtar Kelimeler: Karbapenemaz, blaKPC geni, moleküler epidemiyoloji, üriner sistem enfeksiyonu, modifiye Hodge testi

Kaynakça

1

Nordmann P, Gniadkowski M, Giske CG, Poirel L, Woodford N, Miriagou V; European Network on Carbapenemases. Identification and screening of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae. Clin Microbiol Infect. 2012;18:432-8.

2

Kanerva M, Skogberg K, Ryynänen K, Pahkamäki A, Jalava J, Ollgren J, Tarkka E, Lyytikäinen O. Coincidental detection of the first outbreak of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae colonisation in a primary care hospital, Finland, 2013. Euro Surveill. 2015;20:pii=21172.

3

Yiğit H, Queenan AM, Anderson GJ, Domenech-Sanchez AD, Bıddle JW, Steward CD, Alberti S, Bush K, Tenover FC. Novel carbapenem-hydrolyzing beta-lactamase, KPC-1, from a carbapenem-resistant strain of Klebsiella pneumoniae. Antimicrob Agents Chemother. 2001;45:1151-61.

4

Bae IK, Kang HK, Jang IH, Lee W, Kim K, Kim JO, Jeong SH, Lee K. Detection of Carbapenemases in Clinical Enterobacteriaceae Isolates Using the VITEK AST-N202 Card. Infect Chemother. 2015;47:167-74.

5

Bina M, Pournajaf A, Mirkalantari S, Talebi M, Irajian G. Detection of the Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) in K. pneumoniae isolated from the clinical samples by the phenotypic and genotypic methods. Iran J Pathol. 2015;10:199-205.

6

Nordmann P, Naas T, Poirel L. Global Spread of Carbapenemase producing Enterobacteriaceae. Emerging Infectious Diseases. 2011;17:1791-8.

7

Us E, Tekeli A, Arıkan Akan O, Dolapci I, Şahin F, Karahan ZC. Molecular epidemiology of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae strains isolated between 2004-2007 in Ankara University Hospital, Turkey. Mikrobiyol Bul. 2010;44:1-10.

8

Tseng IL, Liu YM, Wang SJ, Yeh HY, Hsieh CL, Lu HL, Tseng YC, Mu JJ. Emergence of Carbapenemase Producing Klebsiella pneumoniae and spread of KPC-2 and KPC-17 in Taiwan: A Nationwide Study from 2011 to 2013. PLoS One. 2015;10:e0138471.

9

Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. Seventeenth Informational Supplement. Wayne, PA. M100-S17;2007.

10

Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. Nineteenth Informational Supplement. Wayne, PA. M100-S17;2009.

11

Baykal A, Coplu N, Simsek H, Esen B, Gur D. Investigation of the presence of extended spectrum beta-lactamase, KPC- type carbapenemase and plasmid-mediated AmpC beta-lactamase in E. coli and K. pneumoniae strains Isolated from Blood. Mikrobiyol Bul. 2012;46:159-69.

12

Robson RL, Essengue S, Reed NA, Horvat RT. Optochin resistance in Streptococcus pneumoniae induced by frozen storage in glycerol. Diagn Microbiol Infect Dis. 2007;58:185-90.

13

Schechner V, Straus-Robinson K, Schwartz D, Pfeffer I, Tarabeia J, Moskovich R, Chmelnitsky I, Schwaber MJ, Carmeli Y, Navon-Venezia S. Evaluation of PCR-based testing for surveillance of kpc-producing carbapenem-resistant members of the Enterobacteriaceae family. J Clin Microbiol. 2009;47:3261-5.

14

Çiftci İH, Karakeçe E, Aşık G, Demiray T, Er H. An Investigation on the Presence of OXA-48 and KPC in Carbapenem Resistant Klebsiella pneumoniae Strains. ANKEM Derg. 2013;27:49-54.

15

Balkan II, Aygun G, Aydin S, Mutcali SI, Kara Z, Kuskucu M, Midilli K, Şemen V, Aras S, Yemişen M, Mete B, Özaras R, Saltoğlu N, Tabak F, Öztürk R. Blood stream infections due to OXA-48-like carbapenemase-producing Enterobacteriaceae: treatment and survival. Int J Infect Dis. 2014;26:51-6.

16

Vincent JL, Bihari DJ, Suter PM, Bruining HA, White J, Nicolas-Chanoin MH, Wolff M, Spencer RC, Hemmer M. The prevalence of nosocomial infection in intensive care units in Europe. Results of the European Prevalence of Infection in Intensive Care (EPIC) Study. EPIC International Advisory Committee. JAMA. 1995;274:639-44.

17

Samra Z, Ofir O, Lishtzinsky Y, Madar-Shapiro L, Bishara J. Outbreak of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae producing KPC-3 in a tertiary medical centre in Israel. Int J Antimicrob Agents. 2007;30:525-9.

18

Yoon BI, Kim HS, Kim SD, Cho KJ, Kim SW, Ha US, Cho YH5, Sohn DW. Changes in bacterial species and antibiotic sensitivity in intensive care unit: acquired urinary tract infection during 10 years interval (2001-2011). Urol J. 2014;11:1478-84.

19

Kuzucu C, Yetkin F, Gorgec S, Ersoy Y. Investigation of the susceptibilities of extended-spectrum beta-lactamase producing Escherichia coli and Klebsiella spp. strains to ertapenem and other carbapenems. Mikrobiyol Bul. 2011;45:28-35.

20

Cakar A, Akyon Y, GUr D, Karatuna O, Ogunc D, Ozhak Baysan B, Çöplü N, Çağatay M, Kılıç A, Baysallar M, Bakıcı Z, Çelik C, Gülay Z, Aydemir Ş, Tünger A, Kılıç H, Erçal BD, Aşçı Toraman Z, Zer Y, Büyüktaş A, Ay S, Aktaş Z, Kayacan Ç, Bayramoğlu G, Aydın F, Dündar D, Hasdemir U, Ayaş R, Yanık K, Günaydın M, Güdücüoğlu H, Parlak M. Investigation of carbapenemases in carbapenem-resistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae strains isolated in 2014 in Turkey. Mikrobiyol Bul. 2016;50:21-33.

21

Woodford N, Dallow JW, Hill RL, Palepou MF, Pike R, Ward ME, Warner M, Livermore DM. Ertapenem resistance among Klebsiella and Enterobacter submitted in the UK to a reference laboratory. Int J Antimicrob Agents. 2007;29:456-9.

22

Kuskucu MA, Karakullukcu A, Ailiken M, Otlu B, Mete B, Aygun G. Investigation of carbapenem resistance and the first identification of Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) enzyme among Escherichia coli isolates in Turkey: A prospective study. Travel Med Infect Dis. 2016;14:572-6.

23

Güzel Tunçcan Ö, Tozlu Keten D, Dizbay M, Hızel K. Antimicrobial Susceptibility of Ertapenem Comparing with other Antibiotics against Nosocomial Escherichia coli and Klebsiella Strains. ANKEM Derg. 2008;22:188-92.

24

Pecora ND, Li N, Allard M, Li C, Albano E, Delaney M, Dubois A, Onderdonk AB, Bry L. Genomically ınformed surveillance for carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in a health care system. MBio. 2015;6:e01030.

25

Biberg CA, Rodrigues AC, do Carmo SF, Chaves CE, Gales AC, Chang MR. KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae in a hospital in the Midwest region of Brazil. Braz J Microbiol. 2015;46:501-4.

26

Maltezou HC, Giakkoupi P, Maragos A, Bolikas M. Outbreak of infections due to KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae in a hospital in Crete (Greece). J Infect. 2009;58:213-9.

27

Labarca J, Poirel L, Ozdamar M, Turkoglu S, Hakko E, Nordmann P. KPCproducing Klebsiella pneumoniae, finally targeting Turkey. New Microbe New Infect. 2014;2:50-1.

28

Poirel L, Yilmaz M, Istanbullu A, Arslan F, Mert A, Bernabeu S, Nordmann P. Spread of NDM-1-producing Enterobacteriaceae in a neonatal intensive care unit in Istanbul, Turkey. Antimicrob Agents Chemother. 2014;58:2929- 33.

29

Sağıroğlu P, Hasdemir U, Altınkanat Gelmez G, Aksu B, Karatuna O, Söyletir G. Performance of “RESIST-3 O.K.N. K-SeT” immunochromatographic assay for the detection of OXA-48 like, KPC, and NDM carbapenemases in Klebsiella pneumoniae in Turkey. Braz J Microbiol. 2018;49:885-90.

30

Kuskucu MA, Karakullukcu A, Ailiken M, Otlu B, Mete B, Aygun G. Investigation of carbapenem resistance and the first identification of Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) enzyme among Escherichia coli isolates in Turkey: A prospective study. Travel Med Infect Dis. 2016;14:572-6.