Bir Su Ürünleri Yetiştiriciliği Ortamındaki Aeromonas spp. ve Escherichia coli’de Oksitetrasiklin ve Kloramfenikol Duyarlılığının Küme Analizi
PDF

ÖZGÜN MAKALE

Bir Su Ürünleri Yetiştiriciliği Ortamındaki Aeromonas spp. ve Escherichia coli’de Oksitetrasiklin ve Kloramfenikol Duyarlılığının Küme Analizi

Mediterr J Infect Microb Antimicrob 2021;10:5-5 DOI: 10.4274/mjima.galenos.2021.2020.5
, ,
PDF
İzin

Öz

Giriş: Dünya çapında su ürünleri yetiştiriciliğinin büyümesi, süreğen enfeksiyonlara ve antibiyotiğe dirençli bakterilerin (ARB) ortaya çıkmasına neden olmuştur. Bu çalışma, minimum inhibitör konsantrasyon (MIC) verilerine dayanan kümeleme algoritmalarını kullanarak Hindistan’daki Doğu Kolkata sulak alanında ve Kentsel Kolkata’da kültürlenen sazanların otokton bakteriyel florasındaki antibiyotik duyarlılığının benzerliğini ve bağıntısını tanımlamaktadır.

Gereç ve Yöntem: Sazanlardan ve çevrelerinden seçici ortamda izole edilen hareketli Aeromonas spp. ve Escherichia coli (her biri 50) agar-disk difüzyon deneyi kullanılarak oksitetrasikline ve kloramfenikole duyarlılık açısından test edildi. Bu iki antibiyotiğin MIC’leri, agar seyreltme yöntemi kullanılarak belirlenmiş ve BioNumerics 7.6 yazılım paketi kullanılarak kümelenmiştir.

Bulgular: Oksitetrasiklin ve kloramfenikolün MIC’leri sırasıyla 0,39-50 ug/ml ve 1,56 ila >100 ug/ml arasında değişmiştir. Hareketli aeromonadların dendrogram tabanlı küme analizi, ana kümeler altında >5 alt grup elde edildiğinden, nispeten yüksek iç homojenlik göstermiştir. Escherichia coli ayrıca yüksek iç homojenlik göstermiştir. Bir grup olarak hareketli aeromonadların dendrogram tabanlı gelişmiş düğüm küme analizi, daha fazla sayıda küme vermiştir.

Sonuç: Antibiyotik kullanımı öyküsü olmayan bir kültür balıkçılığı ortamından izole edilen hareketli aeromonadlar ve E. coli’de saptanan değişken duyarlılıklar, sazanların ARB’lerle ev ve hastane atıklarından olası kontaminasyonunu düşündürmüştür. Bununla birlikte, bu ortamdan izole edilen E. coli suşları, ciddi bir endişe nedeni olan antibiyotik duyarlılığında yüksek heterojenite sergilemiştir.

Anahtar Kelimeler: Hareketli aeromonadlar, Escherichia coli, antibiyotikler, minimum inhibitör konsantrasyon, küme analizi

Kaynakça

1

Romero J, Feijoó CG, Navarrete P. Antibiotics in aquaculture – Use, abuse and alternatives. in: Carvalho E, David GS, Silva RJ (Eds.). Health and Environment in Aquaculture. InTech, 2012:159-199. Available at: https:// www.intechopen.com/books/health-and-environment-in-aquaculture/

2

World Health Organization (WHO). Antibiotic Resistance, Geneva, Switzerland. Last accessed date: 2019. Available from: https://www.who. int/news-room/fact-sheets/detail/antibiotic-resistance

3

Janda JM, Abbott SL. The genus Aeromonas: taxonomy, pathogenicity, and infection. Clin Microbiol Rev. 2010; 23:35-73.

4

Austin B, Austin DA. Bacterial fish pathogens: Disease of farmed and wild fish. 5th edn. Chichester: Praxis Publication Ltd, 2012.

5

The International Commission on Microbiological Specifications for Foods. Microorganisms in foods (ICMSF). In: Sampling for Microbiological Analysis: Principles and Scientific Applications. 2nd ed. Toronto Press, 1986. Available from: https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/00401706.1977.10489 539

6

Niemi M, Taipalinen I. Faecal indicator bacteria at fish farms. Hydrobiologia. 1982;86:171-5.

7

Oliveira RV, Oliveira MC, Pelli A. Disease infection by Enterobacteriaceae family in Fishes: A review. J Microbiol Exp. 2017;4:e00128.

8

Nadimpalli M, Vuthy Y, de Lauzanne A, Fabre L, Criscuolo A, Gouali M, Huynh BT, Naas T, Phe T, Borand L, Jacobs J, Kerléguer A, Piola P, Guillemot D, Le Hello S, Delarocque-Astagneau E; BIRDY study group. Meat and Fish as Sources of Extended-Spectrum β-Lactamase-Producing Escherichia coli, Cambodia. Emerg Infect Dis. 2019;25:126-31.

9

Department of Animal Husbandry Dairying and Fisheries (DAHDF). Handbook of fisheries statistics: 2017-18. Government of India, New Delhi, 2018.

10

Lin M, Wu X, Yan Q, Ma Y, Huang L, Qin Y, Xu X. Incidence of antimicrobialresistance genes and in tegrons in antibiotic-resistant bacteria isolated from eels and aquaculture ponds. Dis Aquat Org. 2016;120:115-23.

11

Chuah LO, Effarizah ME, Goni AM, Rusul G. Antibiotic application and emergence of multiple antibiotic resistance (MAR) in global catfish aquaculture. Curr Environ Health Rep. 2016;3:118-27.

12

Abraham TJ, Bardhan A. Emergence and spread of antimicrobial resistance in motile aeromonads of the aquaculture environment. Indian J Anim Health. 2019;58:39-52.

13

Rahiman MKM, Hatha MAA, Selvam GAD, Thomas AP. Relative prevalence of antibiotic resistance among heterotrophic bacteria from natural and culture environments of freshwater prawn, Macrobrachium rosenbergii. J World Aquacult Soc. 2016;47:470-80.

14

Ye L, Zhang L, Li X, Shi L, Huang Y, Wang HH. Antibiotic-resistant bacteria associated with retail aquaculture products from Guangzhou, China. J Food Prot. 2013;76:295-301.

15

Kumar S, Lekshmi M, Parvathi A, Nayak BB, Varela MF. Antibiotic resistance in seafood-borne pathogens. In: Singh OV (ed) Food-borne pathogens and antibiotic resistance, Wiley-Blackwell, USA, 2017:397-416.

16

Mainda G, Bessell PR, Muma JB, McAteer SP, Chase-Topping ME, Gibbons J, Stevens MP, Gally DL, deC Bronsvoort BM. Prevalence and patterns of antimicrobial resistance among Escherichia coli isolated from Zambian dairy cattle across different production systems. Sci Rep. 2015;5:12439.

17

Naceur B, Boudjemâa BM. Antibiotic resistance of enterococci isolated from raw camel milk in the South West of Algeria. Afr J Microbiol Res. 2016;10:420-7.

18

Guzzi PH, Masciari E, Mazzeo GM, Zaniolo C. A discussion on the biological relevance of clustering results. In: Bursa M, Khuri S, Renda ME (eds) Information Technology in Bio- and Medical Informatics. ITBAM 2014. Lecture Notes in Computer Science. Springer. 2014:30-44.

19

United States Food and Drug Administration. Approved Aquaculture Drugs (USFDA). Last accessed date: 2019 Apr 12. Available from: https://www.fda. gov/animal-veterinary/aquaculture/approved-aquaculture-drugs

20

Abraham TJ. Food safety hazards related to emerging antibiotic-resistant bacteria in cultured freshwater fish of Kolkata, India. Adv J Food Sci Technol. 2011;3:69-72.

21

Collins CH, Lynes PM, Grange JM, Falkinham III JO. Collins and Lyne’s Microbiological methods. 8th edn. London: Arnold Publishers, 2004.

22

Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance standards for antimicrobial disk susceptibility tests. Approved Standard, 7th ed. Document M02-A11. CLSI Pennsylvania, USA, 2012.

23

Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Methods for antimicrobial susceptibility testing for human mycoplasmas; Approved Guideline. Document M43-A. CLSI, Pennsylvania, USA, 2011.

24

Chai LC, Fatimah AB, Ghazali FM, Lee HY, Tunung R, Shamsinar AT, Laila RAS, Thahirahtul AZ, Malakar PM, Nakaguchi Y, Nishibuchi M, Son R. Biosafety of Campylobacter jejuni from raw vegetables consumed as Ulam with reference to their resistance to antibiotics. Int Food Res J. 2008;15:125-34.

25

Oyelade J, Isewon I, Oladipupo F, Aromolaran O, Uwoghiren E, Ameh F, Achas M, Adebiyi E. Clustering algorithms: their application to gene expression data. Bioinform Biol Insights. 2016;10:237-53.

26

Emmons S, Kobourov S, Gallant M, Börner K. Analysis of Network Clustering Algorithms and Cluster Quality Metrics at Scale. PLoS One. 2016;11:e0159161.

27

Bolin JH, Edwards JM, Finch WH, Cassady JC. Applications of cluster analysis to the creation of perfectionism profiles: a comparison of two clustering approaches. Front Psychol. 2014;5:343.