Öz
Giriş: Ters transkriptaz-polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) testinin kapasitesi tükenmeden hızlı antijen testinin (RAT) kullanılması, olguların uygun şekilde saptanması ve sonuçların zamanında alınması için çok önemlidir. Bu nedenle, bu çalışma, Koronavirüs hastalığı-2019 (COVID-19) tanısında RAT’nin duyarlılığını ve özgüllüğünü değerlendirmek ve RAT’ı RT-PCR yöntemiyle karşılaştırmak için yapılmıştır.
Gereç ve Yöntem: Bu uyum çalışması, İran’ın güneyindeki Fars eyaleti, Şiraz şehrinde COVID-19 testi yapan halk örnekleme merkezlerine sevk edilen 634 kişi üzerinde gerçekleştirildi. Örnekleme işlemi, çok aşamalı ve tabakalı bir protokol izlenerek yapıldı. Faringeal numunelerde referans standart test olarak COVITECH® tek adımlı gerçek zamanlı RT-PCR kiti yöntemi kullanıldı ve E-Health Barakat Company® hızlı antijen kitini kullanan RAT ile karşılaştırma yapıldı. Eğitimli personel verileri topladı. Duyarlılık, özgüllük, pozitif prediktif değer, negatif prediktif değer ve RAT’ın doğruluğu MedCalc yazılımı kullanılarak hesaplandı. Ayrıca, RT-PCR ve RAT arasındaki uyum düzeyini değerlendirmek için Kappa değeri kullanıldı.
Bulgular: Referans test olarak RT-PCR yönteminin sonuçlarına göre, COVID-19 tanısında duyarlılık, özgüllük, Kappa değeri ve RAT’nin doğruluğu sırasıyla %81,82, %92,28, %63,8 ve %91,01 olarak bulundu. Asemptomatik bireylerde, RAT’ın özgüllüğü ve pozitif prediktif değeri %100 olarak gösterildi.
Sonuç: Sonuç olarak, bulgularımız pozitif bir RAT’ın yetişkinlerde COVID-19 teşhisi için önemli bilgiler sağladığını gösterdi. Genel olarak RAT, yüksek duyarlılığı, özgüllüğü ve doğruluğu nedeniyle zaman, maliyet, hız gibi faktörler göz önünde bulundurulduğunda RT-PCR testinin yerini alabilir.
Anahtar Kelimeler: COVID-19, ters transkriptaz polimeraz zincir reaksiyonu, duyarlılık, özgüllük, hızlı
Kaynakça
Traugott M, Aberle SW, Aberle JH, Griebler H, Karolyi M, Pawelka E, Puchhammer-Stöckl E, Zoufaly A, Weseslindtner L. Performance of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 antibody assays in different stages of infection: comparison of commercial enzyme-linked immunosorbent assays and rapid tests. J Infect Dis. 2020;222:362-6.
Zitek T. The appropriate use of testing for COVID-19. West J Emerg Med. 2020;21:470-2.
van Kasteren PB, van der Veer B, van den Brink S, Wijsman L, de Jonge J, van den Brandt A, Molenkamp R, Reusken CBEM, Meijer A. Comparison of commercial RT-PCR diagnostic kits for COVID-19. J Clin Virol. 2020;128:104412.
Santaella-Tenorio J. Alternativas diagnósticas para SARS-CoV-2 para América Latina. Colomb Med. 2020;51.
Cassaniti I, Novazzi F, Giardina F, Salinaro F, Sachs M, Perlini S, Bruno R, Mojoli F, Baldanti F; Members of the San Matteo Pavia COVID-19 Task Force. Performance of VivaDiagTM COVID-19 IgM/IgG Rapid Test is inadequate for diagnosis of COVID-19 in acute patients referring to emergency room department. J Med Virol. 2020;92:1724-7.
European Centre for Disease Prevention and Control. Available from: https://www.ecdc.europa.eu/en/publicationsdata/covid-19-testing-strategies-and-objectives
European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC). Guidance for discharge and ending isolation in the context of widespread community transmission of COVID-19 ASE.
European Commission (EC). Commission Recommendation of 28.10.2020 on COVID-19 testing strategies, including the use of rapid antigen tests. Available from: https://ec.europa.eu/health/system/files/2020-10/covid19_testingstrategies_recommendation_en_0.pdf
Safety European Commission Directorate-General for Health and Food Safety (ECD-GFHAF). Last accessed date. 01.12.2022. Available from: https://ec.europa.eu/health/sites/default/files/preparedness_response/docs/covid-19_rat_common-list_en.pdf
NZYTech genes & enzymes. SARS-CoV-2 One-Step RT-PCR Kit, RdRp and N genes, IVD Viral RNA dependent RNA polymerase (RdRp) and Nucleocapsid phosphoprotein (N) genes. Last accessed date. Available from: https://nzytech.com/files/importfiles/IM-002en%20MD04831_V2103.pdf
World Health Organization (WHO). Laboratory testing strategy recommendations for COVID-19: interim guidance, 22 March 2020. World Health Organization, 2020.
Lambert-Niclot S, Cuffel A, Le Pape S, Vauloup-Fellous C, Morand-Joubert L, Roque-Afonso AM, Le Goff J, Delaugerre C. Evaluation of a rapid diagnostic assay for detection of SARS CoV-2 antigen in nasopharyngeal swab. J Clin Microbiol. 2020;58:e00977.
Blairon L, Wilmet A, Beukinga I, Tré-Hardy M. Implementation of rapid SARS-CoV-2 antigenic testing in a laboratory without access to molecular methods: Experiences of a general hospital. J Clin Virol. 2020;129:104472.
Scohy A, Anantharajah A, Bodéus M, Kabamba-Mukadi B, Verroken A, Rodriguez-Villalobos H. Low performance of rapid antigen detection test as frontline testing for COVID-19 diagnosis. J Clin Virol. 2020;129:104455.
Mak GC, Cheng PK, Lau SS, Wong KK, Lau C, Lam ET, Chan RC, Tsang DN. Evaluation of rapid antigen test for detection of SARS-CoV-2 virus. J Clin Virol. 2020;129:104500.
lbert E, Torres I, Bueno F, Huntley D, Molla E, Fernández-Fuentes MÁ, Martínez M, Poujois S, Forqué L, Valdivia A, Solano de la Asunción C, Ferrer J, Colomina J, Navarro D. Field evaluation of a rapid antigen test (Panbio™ COVID-19 Ag Rapid Test Device) for COVID-19 diagnosis in primary healthcare centres. Clin Microbiol Infect. 2021;27:472.
Linares M, Pérez-Tanoira R, Carrero A, Romanyk J, Pérez-García F, Gómez-Herruz P, Arroyo T, Cuadros J. Panbio antigen rapid test is reliable to diagnose SARS-CoV-2 infection in the first 7 days after the onset of symptoms. J Clin Virol. 2020;133:104659.
Porte L, Legarraga P, Vollrath V, Aguilera X, Munita JM, Araos R, Pizarro G, Vial P, Iruretagoyena M, Dittrich S, Weitzel T. Evaluation of a novel antigen-based rapid detection test for the diagnosis of SARS-CoV-2 in respiratory samples. 2020;99:328-33.
Young S, Taylor SN, Cammarata CL, Varnado KG, Roger-Dalbert C, Montano A, Griego-Fullbright C, Burgard C, Fernandez C, Eckert K, Andrews JC, Ren H, Allen J, Ackerman R, Cooper CK. Clinical evaluation of BD Veritor SARS-CoV-2 point-of-care test performance compared to PCR-based testing and versus the Sofia 2 SARS Antigen point-of-care test. J Clin Microbiol. 2020;59:e02338.
World Health Organization (WHO). Antigen-detection in the diagnosis of SARS-CoV-2 infection using rapid immunoassays: interim guidance, 11 September 2020. World Health Organization, 2020.
Alemany A, Baró B, Ouchi D, Rodó P, Ubals M, Corbacho-Monné M, Vergara-Alert J, Rodon J, Segalés J, Esteban C, Fernández G, Ruiz L, Bassat Q, Clotet B, Ara J, Vall-Mayans M, G-Beiras C, Blanco I, Mitjà O. Analytical and clinical performance of the panbio COVID-19 antigen-detecting rapid diagnostic test. J Infect. 2021;82:186-230.
