Öz
Giriş: Escherichia coli ST131 klonunun görülme sıklığı ve yayılım hızı, araştırılması gereken önemli bir konu olmaya devam etmektedir. Bu çalışmanın amacı, yoğun bakım ve diğer servislerinde yatan hastalardan izole edilen E. coli izolatları içinde, ST131 klonu varlığının gerçek-zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile araştırılmasıdır.
Gereç ve Yöntem: Çalışmaya toplam 200 adet E. coli izolatı dahil edilmiştir. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) varlığını göstermek için çift disk sinerji yöntemi kullanılmıştır. Gerçek-zamanlı PZR yöntemi ile tüm E. coli izolatlarında, ST131 klonu varlığı araştırılmıştır.
Bulgular: Yoğun bakımda yatan hastalardan izole edilen 100 suştan 17 tanesi E. coli ST131 klonu olarak tespit edilmiştir. Bu suşlardan GSBL pozitif olan 51 izolatın 15 (%29,4) tanesi, GSBL negatif olan 49 izolatın iki (%4,1) tanesi E. coli ST131 klonu olarak tespit edilmiştir. Yoğun bakım dışı servislerde yatan hastalardan izole edilen 100 suşun 13 tanesi E. coli ST131 klonu olarak tespit edilmiştir. Bu suşlardan GSBL pozitif olan 35 izolatın 12 (%34,3) tanesi, GSBL negatif olan 65 izolatın bir (%1,5) tanesi E. coli ST131 klonu olarak tespit edilmiştir.
Sonuç: E. coli ST131 klonu, GSBL üreten izolatlarda daha yaygın iken, yoğun bakım ünitelerinde veya yoğun bakım dışı ünitelerde bulunma açısından bir fark görülmemiştir.
Anahtar Kelimeler: E. coli, ST131, yoğun bakım ünitesi
Kaynakça
Levent B. Escherichia, Shigella, Salmonella. In: Başustaoğlu A, Kubar A, Yıldıran ŞT, Tanyüksel M (eds). Klinik Mikrobiyoloji. 9st ed. Ankara: Atlas Kitapçılık, 2009:670-87.
Nicolas-Chanoine MH, Bertrand X, Madec JY. Escherichia coli ST131, an intriguing clonal group. Clin Microbiol Rev. 2014;27:543-74.
Çizmeci Z, Otlu B, Aktaş E, Ördekçi S, Açıkgöz Ö, Güleç N. Investigation of High-Risk ST131 Clone in ESBL-Producing Escherichia coli Isolates Isolated from Urine and Non-urinary Clinical Specimens with MALDI-TOF MS and Real Time PCR. Mikrobiyol Bul. 2018;52:13-22.
Yeşilbağ Z, Çağatay AA, Karadeniz A, Başaran S, Orhun G, Ergin Özcan P, Özsüt H, Eraksoy H. Is there a relationship between rectal colonization and nosocomial infection of patients in intensive care unit? Mikrobiyol Bul. 2015;49:327-39.
Gür D. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamazlar: Epidemiyolojisi ve tanı. In: Arman D, Ünal S, (eds). Yeni ve Yeniden Gündeme Gelen İnfeksiyonlar. Ankara: Bilimsel Tıp Yayınevi, 2009:83-100.
Öztürk CE, Kaya AD, Yücel M, Çalışkan E, Behçet M, Ankaralı H. Comparison of Various Phenotypic Methods in Detection of Extended-spectrum Beta-lactamases. ANKEM Derg. 2010;24:111-6.
Tchesnokova VL, Ottley LL, Sakamoto K, Fierer J, Sokurenko E, Liss MA. Rapid Identification of Rectal Multidrug-resistant Escherichia coli Before Transrectal Prostate Biopsy. Urology. 2015;86:1200-5.
Dhanji H, Doumith M, Clermont O, Denamur E, Hope R, Livermore DM, Woodford N. Real-time PCR for detection of the O25b-ST131 clone of Escherichia coli and its CTX-M-15-like extended-spectrum beta-lactamases. Int J Antimicrob Agents. 2010;36:355-8.
Duman Y, Güçlüer N, Serindağ A, Tekerekoğlu MS. Antimicrobial Susceptibility of E. coli Strains and Presence of Extended-Spectrum Beta Lactamase. Fırat Tıp Dergisi. 2010;15:197-200.
Oğuz Mızrakçı S, Arda B, Erdem HA, Uyar M, Tünger A, Sipahi OR, Ulusoy S. Risk factors for gastrointestinal colonization by ESBL-producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli in anaesthesiology and reanimation intensive care unit. Mikrobiyol Bul. 2013;47:223-9.
Rogers BA, Sidjabat HE, Paterson DL. Escherichia coli O25b-ST131: a pandemic, multiresistant, community-associated strain. J Antimicrob Chemother. 2011;66:1-14.
Şardan YÇ. Hastane enfeksiyonları: tanımlar, sürveyans, epidemilere yaklaşım. In: Wilke Topçu A, Söyletir G, Doğanay M, (eds). Enfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi. 3st ed. İstanbul: Nobel Tıp Kitabevi, 2008:545-57.
Yumuk Z, Afacan G, Nicolas-Chanoine MH, Sotto A, Lavigne JP. Turkey: a further country concerned by community-acquired Escherichia coli clone O25-ST131 producing CTX-M-15. J Antimicrob Chemother. 2008;62:284-8.
Can F, Azap OK, Seref C, Ispir P, Arslan H, Ergonul O. Emerging Escherichia coli O25b/ST131 clone predicts treatment failure in urinary tract infections. Clin Infect Dis. 2015;60:523-7.
Can F, Kurt-Azap O, Nurtop E, Ispir P, Seref C, Ergonul O. Molecular epidemiology of bloodstream-associated Escherichia coli ST131 H30-Rx subclone infection in a region with high quinolone resistance. J Med Microbiol. 2016;65:306-10.
Ismail MD, Ali I, Hatt S, Salzman EA, Cronenwett AW, Marrs CF, Rickard AH, Foxman B. Association of Escherichia coli ST131 lineage with risk of urinary tract infection recurrence among young women. J Glob Antimicrob Resist. 2018;13:81-4.
Lafolie J, Sauget M, Cabrolier N, Hocquet D, Bertrand X. Detection of Escherichia coli sequence type 131 by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry: implications for infection control policies? J Hosp Infect. 2015;90:208-12.
Aktaş E, Otlu B, Erdemir D, Ekici H, Bulut E. A First Insight into Escherichia coli ST131 High-Risk Clone Among Extended-Spectrum Beta-Lactamase-Producing Urine Isolates in Istanbul with the Use of Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass-Spectrometry and Real-Time PCR. Microb Drug Resist. 2017;23:1032-6.
Al-Agamy MH, Shibl AM, Hafez MM, Al-Ahdal MN, Memish ZA, Khubnani H. Molecular characteristics of extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli in Riyadh: emergence of CTX-M-15-producing E. coli ST131. Ann Clin Microbiol Antimicrob. 2014;13:4.
Liu X, Liu H, Li Y, Hao C. Association between virulence profile and fluoroquinolone resistance in Escherichia coli isolated from dogs and cats in China. J Infect Dev Ctries. 2017;11:306-13.
Demirci M, Ünlü Ö, İstanbullu Tosun A. Detection of O25b-ST131 clone, CTX-M-1 and CTX-M-15 genes via real-time PCR in Escherichia coli strains in patients with UTIs obtained from a university hospital in Istanbul. J Infect Public Health. 2019;12:640-4.
