Öz
Giriş: Kolistin, çok ilaca dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatlarının neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde son seçenek antimikrobiyal olarak giderek daha fazla kullanılmaktadır. Kolistin direncinin son zamanlarda tüm dünyada artması sebebiyle duyarlılık testleri için güvenilir yöntemlere olan ihtiyaç daha da önem kazanmıştır. Bu çalışmada, referans sıvı mikrodilüsyon (SMD) yöntemine alternatif olarak geliştirilmiş olan sıvı disk elüsyon (SDE) testinin performansının belirlenmesi amaçlanmıştır.
Gereç ve Yöntem: Çeşitli klinik örneklerden izole edilen toplam 48 adet çok ilaca dirençli Pseudomonas aeruginosa suşu çalışmaya dahil edildi. Sıvı mikrodilüsyon yöntemi, ISO standardı (20776-1) tavsiyelerine göre, SDE testi ise Klinik ve Laboratuvar Standartları Enstitüsü (CLSI) tavsiyelerine göre gerçekleştirildi. Sıvı disk elüsyon testinin kategorik uyum (KU), çok büyük hata (ÇBH) ve büyük hata oranları referans SMD yöntemi ile karşılaştırılarak belirlendi.
Bulgular: Referans SMD yöntemi ile 48 izolatın 47’si duyarlı (%98), 1’i dirençli (%2) olarak saptandı. Sıvı mikrodilüsyon testine göre izolatların minimum inhibitör konsantrasyon dağılımı 0,25-64 mg/l arasında idi. Sıvı disk elüsyon testi de duyarlı 47 izolat ile, dirençli 1 izolatı doğru olarak saptadı. Sıvı disk elüsyon testi SMD ile karşılaştırıldığında KU oranı %100 olarak bulundu. Büyük hata ve ÇBH saptanmadı.
Sonuç: Sıvı disk elüsyon testi, çok ilaca dirençli P. aeruginosa izolatlarında kolistin duyarlılığının belirlenmesinde oldukça iyi bir performans göstermiştir. Bu nedenle referans SMD metodunu uygulamanın mümkün olmadığı sınırlı kaynaklara sahip laboratuvarlarda, SDE testinin pratik ve güvenilir bir yöntem olarak kullanılabileceğini düşünüyoruz.
Anahtar Kelimeler: Pseudomonas aeruginosa, kolistin, sıvı disk elüsyon, sıvı mikrodilüsyon
Kaynakça
El-Sayed Ahmed MAE, Zhong LL, Shen C, Yang Y, Doi Y, Tian GB. Colistin and its role in the Era of antibiotic resistance: an extended review (2000-2019). Emerg Microbes Infect. 2020;9:868-85.
Leshaba TMS, Mbelle NM, Osei Sekyere J. Current and emerging polymyxin resistance diagnostics: A systematic review of established and novel detection methods. J Appl Microbiol. 2022;132:8-30.
Poirel L, Jayol A, Nordmann P. Polymyxins: Antibacterial Activity, Susceptibility Testing, and Resistance Mechanisms Encoded by Plasmids or Chromosomes. Clin Microbiol Rev. 2017;30:557-96.
European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). MIC and zone diameter distributions and ECOFFs. V.12.0. 2022. Last accessed date: 2022 Feb 7. Available from: https://www.eucast.org/mic_distributions_and_ecoffs
Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing; 31th informational supplement. CLSI document M100. 2021. Last accessed date: 2022 Jan 1. Available from: https://clsi.org/standards/products/microbiology/documents/m100
Simner PJ, Bergman Y, Trejo M, Roberts AA, Marayan R, Tekle T, Campeau S, Kazmi AQ, Bell DT, Lewis S, Tamma PD, Humphries R, Hindler JA. Two-Site Evaluation of the Colistin Broth Disk Elution Test To Determine Colistin In Vitro Activity against Gram-Negative Bacilli. J Clin Microbiol. 2019;57:e01163-18.
ISO 20776-1:2019 Susceptibility testing of infectious agents and evaluation of performance of antimicrobial susceptibility test devices — Part 1: Brothmicro-dilution reference method for testing the in vitro activity of antimicrobial agents against rapidly growing aerobic bacteria involved in infectious diseases. Last accessed date: 2022 Feb 5. Available from: https://www.iso.org/standard/70464.html
Humphries RM, Green DA, Schuetz AN, Bergman Y, Lewis S, Yee R, Stump S, Lopez M, Macesic N, Uhlemann AC, Kohner P, Cole N, Simner PJ. Multicenter Evaluation of Colistin Broth Disk Elution and Colistin Agar Test: a Report from the Clinical and Laboratory Standards Institute. J Clin Microbiol. 2019;57:e01269-19.
Butt T, Butt A, Yasmin S, Taj S, Tariq N, Bano S. Antibiotic Disk Elution Method to Determine the Colistin Susceptibility against Enterobacterales and Non-fermenter Bacteria. J Coll Physicians Surg Pak. 2022;32:820-2.
Dalmolin TV, Mazzetti A, Ávila H, Kranich J, Carneiro GIB, Arend LNVS, Becker GN, Ferreira KO, de Lima-Morales D, Barth AL, Pillonetto M. Elution methods to evaluate colistin susceptibility of Gram-negative rods. Diagn Microbiol Infect Dis. 2020;96:114910.
Fenwick AJ, Bergman Y, Lewis S, Yee R, Uhlemann AC, Cole N, Kohner P, Ordak C, Green DA, Schuetz AN, Humphries R, Simner PJ. Evaluation of the NG-Test MCR-1 Lateral Flow Assay and EDTA-Colistin Broth Disk Elution Methods To Detect Plasmid-Mediated Colistin Resistance among Gram-Negative Bacterial Isolates. J Clin Microbiol. 2020;58:e01823-19.
Sarıkaya A, Mumcuoğlu İ, Baran I, Aksoy A, Dinç B. Acinetobacter, Pseudomonas ve Enterobacterales Türlerinde Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde Kolistin Sıvı Disk Elüsyon, Hızlı Resapolimiksin NP ve Sıvı Mikrodilüsyon Yöntemlerinin Karşılaştırılması [Comparision of Colistin Broth Disc Elution, Rapid Resapolymyxin NP and Broth Microdilution Methods in Determining Colistin Sensitivity in Acinetobacter, Pseudomonas and Enterobacterales species]. Mikrobiyol Bul. 2022;56:404-15.
Tüzemen NÜ, Işık Ö, Akça B, Özakın C. Determination of Colistin Resistance in Gram Negative Bacteria by Modified Broth Disk Elution Method. Turk Mikrobiyol Cemiy Derg. 2022;52:184-91.
